Combattre la grippe avec le "big data
BIG DATA Grâce au "big data", des chercheurs ont identifié de nouvelles molécules qui jouent un rôle important dans la réplication du virus de la grippe. Si l'on bloque ces protéines de l'hôte, les virus grippaux peuvent moins bien se reproduire. L'étude internationale à laquelle participe l'Université de Zurich contribue ainsi au développement de nouvelles thérapies et de nouveaux médicaments contre la grippe.Presque chaque année, des épidémies de grippe surviennent pendant les mois d'hiver. Parfois, de nouvelles souches virales peuvent même se propager en pandémies mondiales. Ces dernières années, on a découvert des virus de la grippe A (IAV) dont les mutations les rendent résistants aux médicaments disponibles pour le traitement de la grippe. Cela peut avoir pour conséquence que les patients ne réagissent pas à ces derniers.La grippe est provoquée par des infections dues à des virus grippaux qui se multiplient fortement dans les voies respiratoires. Pour se répliquer à l'intérieur des cellules des voies respiratoires, les virus ont besoin de molécules hôtes. C'est pourquoi on a essayé ces dernières années d'identifier et de bloquer les molécules hôtes importantes pour ce processus, afin de stopper le virus.L'inhibition des protéines de l'hôte réduit la croissance du virusCette approche du traitement de la grippe est également suivie par une étude internationale à laquelle participe l'université de Zurich. Les équipes de chercheurs de Suisse, d'Allemagne et des États-Unis ont évalué les données de publications indépendantes sur les molécules hôtes du VAI. Ces études se focalisent sur l'ensemble des gènes ("GenOMICs ") et des protéines ("ProteOMICs") nécessaires au virus et produisent une très grande quantité de données. L'analyse approfondie de ces bases de données "OMICs" a permis de découvrir 20 molécules hôtes non identifiées jusqu'à présent, qui favorisent la croissance des virus de la grippe A. "Ces protéines hôtes inaltérables sont indispensables à la réplication des virus. Nous pouvons maintenant les utiliser pour stopper la propagation", explique le professeur Silke Stertz de l'Institut de virologie médicale de l'Université de Zurich. L'une de ces protéines hôtes est "UBR4". Cette protéine est nécessaire au virus pour le transport des protéines virales vers la membrane cellulaire et donc pour la construction de nouvelles particules. Cela se passe comme suit : Le virus de la grippe A pénètre dans la cellule hôte et s'y multiplie. Les composants viraux sont ensuite amenés à la surface de la cellule où ils sont assemblés pour former de nouveaux virus. Une seule cellule hôte infectée peut ainsi donner naissance à jusqu'à 20 000 nouveaux virus de la grippe.L'étude montre que le blocage de "UBR4" inhibe la production de nouvelles particules virales dans les cellules infectées. Chez la souris, on est ainsi parvenu à affaiblir la réplication du VAI et à réduire ainsi l'évolution de la maladie. Ainsi, l'étude apporte la preuve que le blocage des molécules de l'hôte est possible en tant que stratégie thérapeutique pour le traitement de la grippe.Un portail web public soutient le développement de médicamentsL'équipe de recherche a créé un portail web simplifié et convivial sur l'interaction entre la grippe et l'hôte. Le site est également accessible à d'autres chercheurs, permet de faire des demandes individuelles et offre des outils d'analyse pour trouver les protéines de l'hôte qui jouent probablement un rôle dans l'infection grippale. Les données publiées peuvent ainsi contribuer au développement de médicaments antigrippaux de la prochaine génération. "Nous comptons sur l'approche et l'utilisation du "big data" décrites dans cette étude pour jeter un pont entre la recherche biomédicale et le développement thérapeutique et pour apporter de nouvelles connaissances sur des questions médicales restées sans réponse jusqu'à présent", explique Sumit Chanda, coauteur de l'étude, du Sanford Burnham Prebys Medical Discovery Institute (SBP) en Californie.
